大咖云集，共话单细胞测序最新进展

　　2023年3月3日，“第二届长三角单细胞组学技术应用论坛”成功在上海举办，论坛邀请了单细胞组学领域几十位大咖专家进行了报告，众多业内同仁针对单细胞技术进行深入的交流，华测艾普作为受邀企业也积极参与了本次论坛。

　　在专家们精彩纷呈的报告中，单细胞测序助力免疫学研究领域的最新进展尤为引人注目。

　　单细胞测序技术概述

　　单细胞测序（Single-cell sequencing）是指获取单个细胞遗传信息的测序技术，即对单个细胞水平上，对基因组或转录组进行提取扩增和高通量测序分析。目前单细胞转录组测序(scRNA-seq)是应用最广泛的单细胞测序方法，也是目前最热门的测序方法，它通过对单个细胞的全部RNA进行提取、逆转录、扩增和测序，然后对测序结果进行分析。

　　单细胞测序技术的原理

　　核心策略包括两种：
　　1、将单细胞分离出来，单独构建测序文库，并进行测序。这种思路通量极低而且成本极高，往往还不足以反应真实的科学问题。

　　图片来源：网络

　　2、基于标签（barcode）的单细胞识别。它的核心思想是：在对每个细胞的mRNA测序前做逆转录时，为其加上独一无二的标签序列。通过这种策略，我们可以通过一次建库，测得上万个单细胞的信息。

　　胃癌免疫细胞单细胞测序

　　胃癌预后相对较差，单细胞转录组测序能够在单细胞水平上对高度复杂的肿瘤微环境中的细胞群体进行特异性分析，从而揭示了未表征的分子复杂性。

　　图片来源：Single-cell RNA sequencing of immune cells in gastric cancer patients^（1）

　　NK细胞对胃癌反应时分泌的更多的抑制性受体和更少的激活性受体：NK细胞是先天免疫的重要组成部分，由于其释放细胞因子的能力和介导对肿瘤细胞的细胞溶解活性，在宿主防御中发挥关键作用。与相邻正常组织相比，胃癌组织中IL8、G0S2、HSPA6、CXCL1等上调，而IGJ、TFF1、NCR2等下调（如下图）。

　　图片来源：Single-cell RNA sequencing of immune cells in gastric cancer patients^（1）

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　　参考文献
　　(1) Single-cell RNA sequencing of immune cells in gastric cancer patients. Aging.2020; 12(3): 2747-2763.
　　(2) Arpaia N, Green JA, Moltedo B, Arvey A, Hemmers S,Yuan S, Treuting PM, Rudensky AY. A Distinct Function of Regulatory T Cells in Tissue Protection. Cell. 2015;162:1078–89.
　　(3) Shalek AK, Satija R, Adiconis X, Gertner RS,Gaublomme JT, Raychowdhury R, Schwartz S, Yosef N, Malboeuf C, Lu D, Trombetta JJ, Gennert D, Gnirke A, et al. Single-cell transcriptomics reveals bimodality in expression and splicing in immune cells. Nature.2013; 498:236–40.