世界帕金森病日 | 关注帕金森病患:靶向代谢组学揭示患者的独特代谢特征

2024-04-26 14:17:22 48

  每年的4月11日是世界帕金森病日,帕金森病(Parkinson's Disease,PD)是一种神经退行性疾病,与多巴胺合成密切相关,多巴胺合成涉及酪氨酸与苯丙氨酸,故苯丙氨酸代谢变化可能影响多巴胺的水平,进而影响PD的发展和进展。


  因此,了解PD与氨基酸代谢之间的关系,对于开发新的治疗策略和药物具有重要意义,对于减缓疾病进展,改善患者生活质量均具有明显临床意义。


  01研究方法


  研究样本为血浆样本,分别来自于27名PD患者、18名健康人士和8名高风险人士,结合液相色谱-电喷雾电离串联质谱(LC-ESI-MS/MS)平台技术进行靶向代谢研究。对于血浆中差异代谢物的组间对比,使用多变量统计分析(如PCA)和单变量统计分析(如Welch's t-test)来进行代谢物差异分析。


  02研究结果


  研究发现PD患者血浆中反式肉桂酸(苯丙氨酸代谢物)高于对照组,而苯丙氨酸、酪氨酸、L-多巴、多巴胺代谢物、去甲肾上腺素和3-羟基蒽醌酸则发生下调。表明PD患者苯丙氨酸代谢可能发转向于生产反式肉桂酸,从而导致酪氨酸减少。此外,酪氨酸、多巴胺和去甲肾上腺素相关的多种代谢物水平亦发生变化。


  03研究结论


  研究表明PD患者中苯丙氨酸代谢的改变,与多巴胺能、肾上腺能和5-羟色胺能神经退行性变化有明显关联,这些代谢变化可能代表了PD早期阶段的代谢特征,与PD的发病机制有密切联系。因此研究具有较为重要临床意义,可为开发新的治疗策略和药物提供帮助,并有助于减缓疾病的进展,改善患者的生活质量。


  04研究结果展开


  图1.卡通图解释代谢控制理论(MCA)


  根据这种理论,代谢通路中的激活剂、抑制剂或效应物浓度变化可影响通路中酶的表达或活性,本文开展代谢组学研究,即侧重于了解苯丙氨酸、色氨酸、L-苯丙氨酸解氨酶(PAL)和苯丙氨酸羟化酶(PAH)的变化情况。


  图2.展示了如何评估不同聚类方案,以区分PD患者、健康对照组和高风险对照组的代谢物差异


  a.展示主成分(PCs)数量与解释方差比率对应关系,用于确定聚类分析的最佳主成分数量,可解释组间数据的变异。

  b.肘部图(Elbow Plot)显示最佳聚类数量,随着聚类数量的增加,聚类内的总方差(Within-cluster Sum of Squares,WSS)减少,理论上“肘部”处即为最佳聚类数量。


  图3.展示几种不同聚类方案下样本分布情况,即主成分分析(PCA)数据可视化结果


  图中Silhouette Visualizer为可视化聚类算法结果的工具,其中轮廓系数(silhouette coefficient)的值范围从-1到1,值越高表示样本在其聚类内部的相似性越高,而与其他聚类的相似性则越低,即聚类效果越好。


  a.显示2个聚类情况下的PCA分析结果,即健康对照组(C)和帕金森病(PD)患者/高风险对照组。

  b.显示3个聚类情况下的PCA分析结果,即健康对照组(C)和帕金森病(PD)患者/高风险对照组。

  c.显示4个聚类情况下的PCA分析结果。

  d.显示5个聚类情况下的PCA分析结果。


  表1.Welch t检验显示健康对照组(C)、帕金森病(PD)患者组和高风险对照组(HC)之间代谢物的差异


  其中C组中313个代谢物高于P组,307个代谢物高于HC组;P组中11种代谢物高于C组,22个高于HC组;HC组中4个代谢物高于P组,4种代谢物高于C组。


  图4.展示帕金森病(PD)相关代谢通路的变化


  基于KEGG数据库分析,可发现与健康对照组(C)相比,PD患者(P)组,高风险对照组(HC)中已知的代谢物变化。图中蓝色框显示在PD患者中降低的代谢物,橙色框表示在PD患者中升高的代谢物,黄色阴影表示仅在PD患者中出现的代谢物,蓝色阴影表示PD临床症状发展中起作用的代谢物。


  表2.展示健康对照组(C)、帕金森病(PD)患者组(P),及高风险对照组(HC)间特定代谢物水平差异


  数据进一步细分为不同簇(如Cluster 1,Cluster 2,Cluster 3),每个簇代表了代谢物在这些组别中的不同变化模式。比如Cluster 1展示了C组中高于HC和P组的代谢物,而Cluster 2展示了在C和P之间没有显著差异但高于HC组的代谢物。


  图5.热图显示第二簇(Cluster 2)中健康对照组(C)、帕金森病(PD)患者组(P),以及高风险对照组(HC)之间的差异代谢物。


  图6.显示苯丙氨酸代谢途径


  包含通过苯丙氨酸羟化酶(PAH)和L-苯丙氨酸氨解酶(PAL)两种代谢过程,展示了苯丙氨酸如何通过这两种酶的作用转化为酪氨酸(通过PAH)和反式肉桂酸(通过PAL)。并展示了PD患者中其他关键代谢物,如多巴胺、去甲肾上腺素、酪氨酸等的变化。


  05总结与启发


  该篇文献发表于Frontiers in Molecular Biosciences(IF>5),从这篇文章中,我们可以了解或借鉴到这篇文献的实验设计思路:


  1.科研假设基于帕金森病(PD)与多巴胺代谢,以代谢组学技术来探索PD患者中苯丙氨酸代谢的变化;

  2.实验基于PD患者、健康对照组和高风险对照组三组的血浆样本,以LC-ESI-MS/MS平台技术进行代谢组学分析;

  3.数据处理应用多变量统计分析(如PCA)和单变量统计分析(如Welch's t-test)来评估组间代谢物差异;

  4.结果解读根据代谢物的变化,认为PD患者中,苯丙氨酸代谢通过PAL而非PAH途径进行,讨论代谢物变化对PD,特别是对多巴胺能、肾上腺能和5-羟色胺能系统的影响。


  本研究提供了PD患者苯丙氨酸代谢途径的改变,为开发生物标志物和治疗靶点提供潜在方向。未来的研究可以进一步探索这些代谢变化与PD临床症状之间的联系,并评估这些代谢物作为治疗反应和疾病进展监测工具的潜力。


  参考文献

  Shebl,N.,El-Jaafary,S.,Saeed,A.A.,et al.(2024).Metabolomic profiling reveals altered phenylalanine metabolism in Parkinson's disease in an Egyptian cohort.Front.Mol.Biosci.,11,1341950.doi:10.3389/fmolb.2024.1341950.

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